奥特曼格斗进化3拥有众多隐藏奥特战士与怪兽角色，解锁条件各有不同。爱迪需全奥特任务达A评级并通关全部战斗、十大据点;佐菲要按初代、赛文等顺序通关战斗模式。阿斯特拉、阿古茹、杰斯提斯需对应角色完成专属对战关卡，雷杰多通关高斯关卡拿A级即可临时解锁。贝蒙斯坦、雷德王、哥莫拉、杰顿、达达、葛洛卡主教则要完成指定剧情关卡并达成对应通关要求，集齐全部角色需完成各类模式挑战。

奥特曼格斗进化3全人物解锁方法

1、爱迪奥特曼：奥特模式十八个任务评级A及以上，所有奥特曼都通过一次战斗模式，所有奥特曼都通过一次十大据点(不包括雷杰多奥特曼、艾斯机器人、妄想奥特赛文、邪恶迪迦以及假戴拿奥特曼)

2、佐菲：按照奥特曼，奥特赛文，杰克奥特曼，艾斯奥特曼，泰罗奥特曼这个顺序分别通关一次战斗模式。若中途失败，接着那个角色重来即可，无需从头开始。但若是中途替换角色，则须从头开始。

3、阿斯特拉：战斗模式中使用雷欧奥特曼使用“奥特双重闪光”击败所有敌人后出现。

4、阿古茹奥特曼：通关「决战之日」，在战斗模式使用盖亚奥特曼(盖亚V2)击败阿古茹奥特曼后出现。

5、杰斯提斯奥特曼：关卡「高斯VS杰斯提斯」中由高斯奥特曼(日蚀模式)击败杰斯提斯奥特曼并通关后获得

6、雷杰多奥特曼：关卡「高斯VS杰斯提斯」中获得评级A及以上获得。但重启游戏后角色会消失，需要重新获得，但是可以用PS2模拟器临时保存。该角色无法在训练模式使用，无法调整技能。

7、贝蒙斯坦：关卡「怪兽标本」中由贝蒙斯坦击败奥特曼并通关后出现。

8、哥莫拉：关卡「怪兽殿下」获得评级A及以上出现。

9、杰顿：关卡「再见奥特曼」中由佐菲击败杰顿并获得评级A及以上后出现。

10、达达：奥特模式初始任务全部获得评级B及以上后出现。

11、葛洛卡主教：在联手作战模式中使用高斯奥特曼和杰斯提斯奥特曼通关一次后出现。

12、雷德王：关卡「怪兽标本」中由雷德王击败奥特曼并通关后出现。